Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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