Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms