Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms