Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms