Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms