Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC13P55735 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC13P55735 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC13P55735 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC13P55735 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC13P55735 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC13P55735 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC13P55735 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC13P55735 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC13P55735 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC13P55735 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC13P55735 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC13P55735 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC13P55735 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEC13P55735 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEC13P55735 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC13P55735 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC13P55735 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC13P55735 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC13P55735 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC13P55735 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC13P55735 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC13P55735 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC13P55735 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC13P55735 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC13P55735 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC13P55735 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms