Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms