Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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