Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms