Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms