Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIN28AQ9H9Z2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIN28AQ9H9Z2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIN28AQ9H9Z2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIN28AQ9H9Z2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIN28AQ9H9Z2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms