Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms