Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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