Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP4Q8N2S1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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