Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms