Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms