Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATRQ13535 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATRQ13535 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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