Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATMQ13315 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATMQ13315 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATMQ13315 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ATMQ13315 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATMQ13315 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATMQ13315 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATMQ13315 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATMQ13315 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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