Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX3P78415 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX3P78415 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX3P78415 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms