Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms