Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms