Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn5F6UCX4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms