Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms