Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms