Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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