Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms