Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms