Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAX2Q9UIW0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms