Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cml5Q9QXS8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cml5Q9QXS8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms