Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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