Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms