Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms