Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IGSF1Q8N6C5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF1Q8N6C5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms