Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms