Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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