Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms