Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms