Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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