Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSFMP43897 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSFMP43897 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSFMP43897 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSFMP43897 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSFMP43897 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSFMP43897 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSFMP43897 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TSFMP43897 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSFMP43897 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSFMP43897 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSFMP43897 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSFMP43897 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSFMP43897 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms