Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YY1P25490 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YY1P25490 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YY1P25490 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
YY1P25490 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
YY1P25490 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YY1P25490 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms