Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PTPRAP18433 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PTPRAP18433 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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PTPRAP18433 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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PTPRAP18433 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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PTPRAP18433 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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PTPRAP18433 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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