Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYF2O95926 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYF2O95926 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYF2O95926 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYF2O95926 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYF2O95926 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYF2O95926 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYF2O95926 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYF2O95926 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYF2O95926 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYF2O95926 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms