Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ALKQ9UM73 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms