Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms