Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms