Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

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Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Calr3Q9D9Q6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Calr3Q9D9Q6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Calr3Q9D9Q6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Calr3Q9D9Q6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Calr3Q9D9Q6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Calr3Q9D9Q6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Calr3Q9D9Q6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Calr3Q9D9Q6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Calr3Q9D9Q6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calr3Q9D9Q6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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