Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop56Q9D6Z1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms