Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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