Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CITED1Q99966 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CITED1Q99966 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms