Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms